僕の説明がへただったため 伝わらなかった部分があったようです。 大規模なインデックスを作る場合 いっぺんに作るとうまくいかない場合がありますが、 複数回に分ければうまくいく場合があります。 普通にcronでインデックスを更新する場合は多分何の問題もないと思います。 更新されるファイルがせいぜい1000以内ならたいてい安全だと思います。